Même l'arabica sauvage poussant dans les forêts nuageuses d'Éthiopie est sensible à la rouille des feuilles du caféier. Cependant, l'environnement forestier ombragé et le climat frais de cette région sont moins favorables à la croissance de la rouille des feuilles.
La rouille des feuilles du caféier (CLR) est causée par le champignon appelé Hemileia Vastatrix.
Le CLR infecte le dessous des feuilles des plants de café où il produit de grandes colonies d'uredosori de couleur rouille – une belle façon de dire pustule.
La rouille des feuilles produit des spores à un taux 2 000 fois plus élevé à des températures comprises entre 22 et 27 °C qu'à une température comprise entre 18 et 23 °C.
Il existe un lien direct entre la faiblesse des prix du café et les épidémies de parasites et de maladies : « Toutes les épidémies intenses connues au cours des 37 dernières années en Amérique centrale et en Colombie ont été concomitantes avec des périodes de faible rentabilité du café en raison de la baisse des prix du café » (Avelino et al. , 2016)
Il n’existe pas de variétés de café en production totalement immunisées contre la rouille des feuilles du caféier.
La plupart des traitements conventionnels et biologiques sont des pulvérisations foliaires à base de cuivre qui s'accumulent comme polluant dans le sol lors d'une utilisation prolongée.
Le Dr Jacques Avelino a démontré qu'une nutrition optimale des plantes via une fertilisation contrôlée est plus bénéfique pour réduire l'infestation de rouille que l'utilisation de fongicides.
Les cerises infectées développent des lésions sombres qui commencent à libérer des spores provenant de petites fleurs sortant du centre des lésions, appelées acervules. La maladie provoque la chute des fruits avant qu'ils ne soient mûrs et, lorsqu'aucun contrôle n'est mis en œuvre, elle peut entraîner des pertes de récolte de 70-80%.
Le Robusta semble être totalement résistant, mais aucun génotype de café Arabica ne s'est révélé totalement résistant au CBD. Certains cultivars et hybrides d’arabica comme le Ruiru 11 et le Soudan Rume ont une bonne résistance au CBD.
La maladie du flétrissement du café (MDC) attaque le xylème de l'usine.