Спешиалти кофе обычно хранят в виде пергамента до тех пор, пока не найдется покупатель и не будут подписаны контракты. В течение этого времени необходимо безопасно хранить его в среде, где он не будет высыхать и не впитывать лишнюю влагу. Сельмар и др., (2008) предполагают, что кофейный пергамент необходимо хранить в среде с относительная влажность 63% и температуре 22 ° C (72 ° F), независимо от того, через какой процесс прошли бобы. Если кофе хранится слишком долго, эмбрионы кофейных зерен погибнут, обычно через 6 месяцев (Schwan et al., 2012). После гибели эмбриона такие ферменты, как полифенолоксидаза (PPO) и лакказа может оставаться жизнеспособным, если бобы имеют влажность выше 20%; эти неподходящие условия хранения позволят бобам регидратироваться. Действие PPO и лакказы затем вызовет окисление фенольных соединений, что снизит качество (Сельмар и др., 2008 г.).